在現(xiàn)代農(nóng)業(yè)科技的浪潮中，育種技術(shù)的創(chuàng)新已成為推動(dòng)產(chǎn)業(yè)升級(jí)的關(guān)鍵力量。今天，我們要介紹的是由中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院北京畜牧獸醫(yī)研究所與北京康普森生物技術(shù)有限公司聯(lián)合推出的兩大育種利器——“京芯一號(hào)mini”芯片和數(shù)字化肉雞聯(lián)合育種平臺(tái)。這兩項(xiàng)技術(shù)的聯(lián)袂登場，預(yù)示著我國肉雞育種產(chǎn)業(yè)即將迎來一個(gè)新的里程碑。

“京芯一號(hào)”的誕生可以追溯到我國肉雞育種的創(chuàng)新進(jìn)程。2017年，中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院北京畜牧獸醫(yī)研究所與北京康普森生物技術(shù)有限公司共同研發(fā)了國內(nèi)首款自主肉雞育種SNP芯片——京芯一號(hào)55K。

基于“京芯一號(hào)”的肉雞基因組選擇技術(shù)至今已應(yīng)用于多家國家級(jí)核心育種場，累積檢測樣本超15萬，該芯片的應(yīng)用加速了我國自主培育白羽肉雞“廣明2號(hào)”、黃羽肉雞“金陵黑鳳雞”、“潭牛文昌雞”等品種的育成，為打好種業(yè)翻身仗提供堅(jiān)實(shí)的技術(shù)支撐。然而，隨著育種企業(yè)對(duì)降低成本和提升效率的需求日益迫切，京芯一號(hào)mini應(yīng)運(yùn)而生。

?芯片特點(diǎn)

“京芯一號(hào)mini”是基于“京芯一號(hào)”55K芯片的位點(diǎn)降維版本，它保留了在不同商業(yè)化黃羽、白羽肉雞的高質(zhì)量位點(diǎn)，以及與飼料報(bào)酬、生長、肉質(zhì)、胴體、繁殖和抗病等功能位點(diǎn)，與京芯一號(hào)55K可以通過填充技術(shù)無縫銜接，可應(yīng)用于基因組選擇、親緣關(guān)系判定、遺傳多樣性評(píng)估等工作，實(shí)現(xiàn)了遺傳評(píng)估的高準(zhǔn)確性的同時(shí)，將基因檢測成本降低了40%以上。

?芯片應(yīng)用情況-產(chǎn)品性能

京芯一號(hào)mini在不同品系位點(diǎn)多態(tài)性表現(xiàn)優(yōu)異，樣本檢測率可達(dá)99.8%。

?芯片應(yīng)用情況-填充及遺傳評(píng)估效果

京芯一號(hào)mini芯片與京芯一號(hào)55K聯(lián)合使用，不同品系參考面板數(shù)量達(dá)1000樣本時(shí)，填充準(zhǔn)確性可達(dá)98.5%，同時(shí)京芯一號(hào)mini填充到京芯一號(hào)55K芯片進(jìn)行育種值評(píng)估與直接應(yīng)用京芯一號(hào)55K芯片各性狀育種值相關(guān)性可達(dá)99.5%以上。

與“京芯一號(hào)mini”相輔相成的是數(shù)字化肉雞聯(lián)合育種平臺(tái)。該平臺(tái)融合了尖端信息技術(shù)、計(jì)算機(jī)科學(xué)、數(shù)量遺傳學(xué)和基因組學(xué)的最新成果，實(shí)現(xiàn)了數(shù)據(jù)的智能整合、多條件數(shù)據(jù)質(zhì)控、多維度個(gè)體追蹤和精準(zhǔn)核心表型提取功能。在開發(fā)技術(shù)上平臺(tái)基于Spring Boot框架，采用B/S架構(gòu)和MySQL數(shù)據(jù)庫技術(shù)，將現(xiàn)有基因組選擇工作中的樣本采集、生產(chǎn)管理、育種管理等環(huán)節(jié)進(jìn)行深入融合，實(shí)現(xiàn)了企業(yè)數(shù)據(jù)全鏈條規(guī)范管理、多任務(wù)協(xié)調(diào)處理、一鍵化遺傳評(píng)估的功能，進(jìn)一步推進(jìn)了育種企業(yè)的信息化進(jìn)度。

“京芯一號(hào)mini”與數(shù)字化肉雞聯(lián)合育種平臺(tái)的結(jié)合使用，企業(yè)前期使用京芯一號(hào)55K芯片構(gòu)建GS參考群的同時(shí)構(gòu)建填充面板，后續(xù)基于聯(lián)合育種平臺(tái)用戶可以根據(jù)自己的育種需求，選擇合適的分析模型，并依托全自動(dòng)化育種評(píng)估模塊對(duì)京芯一號(hào)mini芯片檢測的候選群進(jìn)行育種值評(píng)估，快速生成詳盡的評(píng)估報(bào)告，極大提高了育種工作的效率。

注：為保證參考面板的準(zhǔn)確性，選入核心群的個(gè)體再進(jìn)行京芯一號(hào)55K芯片補(bǔ)測，可大大降低候選群基因檢測成本。

隨著“京芯一號(hào)mini”與數(shù)字化肉雞聯(lián)合育種平臺(tái)的推出，我們相信，我國肉雞育種產(chǎn)業(yè)將迎來更加廣闊的發(fā)展前景。這兩項(xiàng)技術(shù)的結(jié)合，不僅將加速新品種的培育，也將為我國肉雞種業(yè)的國際競爭力供堅(jiān)實(shí)的技術(shù)支撐。