據報道,西南大學生命科學學院教育部重點實驗室徐洛浩教授課題組日前在《美國科學院院刊》(PNAS)發表題為《家雞基因組完成圖的演化分析》(Evolutionary analysis of a complete chicken genome)的研究論文,在國際上率先繪制成功一個家雞的全基因組完成圖。
圖為家雞基因組GGswu1包含10條“點染色體”。 西南大學 供圖
這是基因組完成圖譜繪制技術首次在經濟動物中的應用,公布了雞基因組的完整序列,揭示了以往家雞基因組組裝中所缺失的6個染色體模型,將為理解脊椎動物基因組演化和染色體生物學提供新見解,為家雞遺傳育種提供重要基礎。同時,這也是基因組完整圖譜繪制技術首次應用在經濟動物中。
圖為脊索動物核型演化全景圖。 西南大學 供圖
據介紹,雞是最重要的脊椎動物模式生物之一。近年來,中國肉雞自主育種不斷取得突破,但仍存在起步晚、種質資源積累不足等問題。家雞基因組完成圖的繪制,是精準分子設計育種的重要基礎,是海內外同行緊密攻克的難題之一,對肉雞遺傳育種工作的推進具有重要意義。
西南大學教授徐洛浩稱,該團隊以中國特有家雞品系“胡須雞”為材料,歷時兩年半,利用長讀長測序技術,完成了一只母雞的全基因組圖譜繪制,破譯了家雞基因組39條染色體的完整序列。基于此,研究人員繪制了脊索動物染色體演化全景圖,重構了45條脊椎動物祖先染色體。
圖為家雞近端粒著絲粒包含HORs。 西南大學 供圖
同時,研究論文闡明了家雞著絲粒的起源、序列構造及多樣性。課題組還精細刻畫了W性染色體的表觀遺傳學特征。
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