11月3日-5日，第五屆（2024）新豬派養(yǎng)豬產(chǎn)業(yè)峰會(huì)在溫氏總部所在地、“六祖故里”云浮新興隆重舉行。以“創(chuàng)新質(zhì)·增效率”為主題，匯集國(guó)內(nèi)養(yǎng)豬產(chǎn)業(yè)行業(yè)專家、TOP50豬企“掌舵人”和產(chǎn)業(yè)鏈上下游業(yè)界精英，共同探索如何通過(guò)科技創(chuàng)新提升新質(zhì)生產(chǎn)力，推動(dòng)養(yǎng)豬行業(yè)增產(chǎn)提效，實(shí)現(xiàn)更加綠色、高效、可持續(xù)的發(fā)展。

華南農(nóng)業(yè)大學(xué)獸醫(yī)學(xué)院教授張桂紅在會(huì)上做《宏基因組測(cè)序在養(yǎng)豬一線的應(yīng)用》主題報(bào)告。她表示，宏基因組測(cè)序方法在臨床復(fù)雜的豬病環(huán)境條件下，通過(guò)對(duì)結(jié)果的有效分析，確定豬場(chǎng)是否存在混合感染、病原毒株類型及變異、重組情況，從而精確的做出治療與防控方案，也可以排查豬場(chǎng)的管理問(wèn)題。

華南農(nóng)業(yè)大學(xué)獸醫(yī)學(xué)院教授張桂紅做《宏基因組測(cè)序在養(yǎng)豬一線的應(yīng)用》主題報(bào)告

本次大會(huì)由新豬派、華南農(nóng)業(yè)大學(xué)鄉(xiāng)村振興與社會(huì)服務(wù)處聯(lián)合主辦，華農(nóng)農(nóng)梓鄉(xiāng)村振興產(chǎn)業(yè)研究中心承辦，溫氏股份和勃林格殷格翰聯(lián)合舉辦。新豬派特邀近100位權(quán)威專家和行業(yè)龍頭企業(yè)嘉賓，以及部分萬(wàn)頭能繁母豬企業(yè)和業(yè)內(nèi)優(yōu)秀養(yǎng)殖企業(yè)嘉賓400余人參會(huì)，總養(yǎng)殖規(guī)模覆蓋超400萬(wàn)頭母豬，共同圍繞創(chuàng)新發(fā)展、成本優(yōu)化、效率提升等話題展開(kāi)討論，共同尋覓存量時(shí)代下中國(guó)農(nóng)牧企業(yè)的破局之道。

高通量測(cè)序：養(yǎng)豬一線的新利器

在養(yǎng)豬一線，疾病的防控一直是養(yǎng)殖者最為關(guān)注的問(wèn)題之一。在面對(duì)復(fù)雜的豬病感染時(shí)，如何快速的判斷出病原是至關(guān)重要的，而基因測(cè)序正是實(shí)現(xiàn)這一目標(biāo)的重要手段之一。當(dāng)前的測(cè)序方法包括一代（Sanger測(cè)序法）、二代（高通量測(cè)序）和三代（納米孔測(cè)序）。一代測(cè)序，即經(jīng)典的Sanger測(cè)序法，以其高準(zhǔn)確度和長(zhǎng)讀長(zhǎng)著稱，是早期基因研究的重要工具，但Sanger法難以覆蓋所有可能的病原體，隨著高通量測(cè)序技術(shù)在生命科學(xué)和醫(yī)學(xué)領(lǐng)域的日益廣泛應(yīng)用，這一先進(jìn)技術(shù)已被成功引入養(yǎng)豬業(yè)的疾病防控中，在了解豬場(chǎng)病原感染情況具有一定的意義。

張桂紅老師指出，一代測(cè)序法在現(xiàn)在依然是最基礎(chǔ)的，不可取代的一種測(cè)序方式。但在應(yīng)對(duì)當(dāng)前復(fù)雜的豬病形勢(shì)時(shí)，其通量小的缺陷日益凸顯，難以滿足大量病原體的檢測(cè)需求。相比之下，宏基因組測(cè)序方法能夠一次性篩查病料中的所有病原，從而全面了解豬群的感染狀況。

在ASFV、PRRSV以及腹瀉類疫病和臨床復(fù)雜的疫病環(huán)境條件下，通過(guò)高通量測(cè)序并對(duì)結(jié)果進(jìn)行分析，可以判讀感染病原的毒株類型及變異、重組情況，豬場(chǎng)混合感染情況，預(yù)估毒株致病性，同時(shí)也可以排查豬場(chǎng)的管理問(wèn)題。

張桂紅老師還分享了她們課題組的高通量測(cè)序平臺(tái)，并鼓勵(lì)大型養(yǎng)殖集團(tuán)建立自己的測(cè)序平臺(tái)以提升疫病防控能力。然而，對(duì)于小養(yǎng)殖戶而言，由于建設(shè)測(cè)序平臺(tái)成本較高，建議將測(cè)序工作交由專業(yè)的檢測(cè)公司來(lái)完成。

疫病成豬企降成本“攔路虎”，宏基因組測(cè)序助力精準(zhǔn)防控

疫病是當(dāng)今豬企降低成本路上最大的“攔路虎”。在養(yǎng)豬業(yè)中，非洲豬瘟和豬藍(lán)耳病的防控尤為重要。這兩種疾病都具有高度的接觸傳染性，可以引發(fā)免疫抑制，導(dǎo)致豬群整體健康水平下降，生產(chǎn)效益受損。除此之外，ASFV、PRRSV容易發(fā)生重組變異，復(fù)雜性和威脅性日益凸顯。在這一背景下，宏基因組測(cè)序技術(shù)憑借其測(cè)得多、測(cè)得快的優(yōu)勢(shì)，得到了廣泛應(yīng)用。它通過(guò)對(duì)檢測(cè)樣本中的基因進(jìn)行打斷、擴(kuò)增、捕獲和測(cè)序，然后與數(shù)據(jù)庫(kù)進(jìn)行對(duì)比，就可以分析出樣本中含有什么病原體。這種技術(shù)不僅適用于已知病原體的檢測(cè)，還能發(fā)現(xiàn)未知病原體，從而實(shí)現(xiàn)對(duì)病原體的全面檢測(cè)。

張桂紅老師指出，現(xiàn)有商品化試劑盒和傳統(tǒng)一代測(cè)序存在局限，無(wú)法全面檢測(cè)病原體。而且傳統(tǒng)的一代測(cè)序得到的序列只能了解到病毒的基因型和基因缺失位點(diǎn)，但是看不到整個(gè)全基因組序列。而宏基因組測(cè)序能一次性獲取病原全基因組序列，追溯病原起源。

養(yǎng)豬集團(tuán)可借此技術(shù)建立報(bào)告體系，通過(guò)比較不同時(shí)間點(diǎn)病毒株的差異，及時(shí)發(fā)現(xiàn)生物安全漏洞，排查新病原體入侵風(fēng)險(xiǎn)。此外，宏基因組測(cè)序還能鑒別野毒與疫苗毒，評(píng)估毒性及混合感染情況，為疫病防控提供有力支持。

豬場(chǎng)健康體檢：選擇合適測(cè)序技術(shù)，兼顧成本與準(zhǔn)確性

健康體檢是對(duì)豬群進(jìn)行的一種全面體檢方式，通過(guò)收集不同群體的樣品并合并，利用宏基因測(cè)序技術(shù)，可以鑒定出細(xì)菌、病毒、寄生蟲(chóng)及真菌等多種病原。目前張桂紅老師團(tuán)隊(duì)的測(cè)序平臺(tái)已經(jīng)能夠一次性建立多個(gè)模塊，識(shí)別出大約70多種常見(jiàn)的病毒和細(xì)菌，并對(duì)其進(jìn)行分型、建立血清型，同時(shí)鑒定耐藥基因。

通過(guò)宏基因測(cè)序，豬場(chǎng)可以了解到整個(gè)豬群中存在的病毒和細(xì)菌種類，以及它們的血清型和耐藥基因情況。這些信息對(duì)于制定最佳的疫苗選擇和用藥指導(dǎo)至關(guān)重要。例如，根據(jù)血清型選擇相應(yīng)的疫苗，以及避免使用對(duì)耐藥基因無(wú)效的藥物等。

但是張桂紅老師表示，宏基因測(cè)序與一代測(cè)序各有優(yōu)缺點(diǎn)。宏基因測(cè)序速度快但可能不夠準(zhǔn)確，而熒光定量的PCR雖然價(jià)格便宜且準(zhǔn)確，但只能針對(duì)已知病原進(jìn)行檢測(cè)。因此，豬場(chǎng)在選擇測(cè)序方法時(shí)，應(yīng)考慮成本、準(zhǔn)確性和時(shí)間等因素，根據(jù)自身實(shí)際情況和需求，選擇合適的測(cè)序方法，并結(jié)合熒光定量PCR等技術(shù)進(jìn)行綜合判斷。同時(shí)，要注意成本控制，避免盲目追求高成本的測(cè)序技術(shù)而忽略生產(chǎn)實(shí)際。

本次大會(huì)還得到了溫氏食品集團(tuán)股份有限公司、江蘇勃林格殷格翰生物制品有限公司、碩騰（上海）企業(yè)管理有限公司、金宇生物技術(shù)股份有限公司、天津瑞普生物技術(shù)股份有限公司、合肥拉塞特機(jī)器人科技有限公司、寧波三生生物科技股份有限公司、浙江海正動(dòng)物保健品有限公司、佛山市正典生物技術(shù)有限公司、浙江康牧動(dòng)物保健股份有限公司、南牧裝備科技有限公司、華威特（江蘇）生物制藥有限公司、廣東廣墾畜牧集團(tuán)股份有限公司、青島瑞爾唯特生物技術(shù)有限公司、海博萊·中國(guó)、江蘇南農(nóng)高科技股份有限公司、江西加大集團(tuán)有限公司、史記生物技術(shù)有限公司、廣州樸成生物科技有限公司、廣東永順生物制藥股份有限公司、重慶國(guó)豬大健康科技有限公司、寧波科瑞特動(dòng)物藥業(yè)有限公司、山東魯抗舍里樂(lè)藥業(yè)有限公司、江西成必信生物科技股份有限公司、上海蒂默曼生物科技有限公司、自然集團(tuán)（中國(guó)）有限公司……等30多家國(guó)內(nèi)外優(yōu)秀企業(yè)的大力支持！